Em diversas máquinas, o X é normalmente iniciado após o boot. Neste caso, para o usuário utilizar o sistema, é preciso entrar com o seu username e a sua senha em alguma janela de diálog específica.
Quando o X Window não é iniciado após o boot, o comando
startx
O gerenciador de janelas é quem arruma na tela todo o arsenal de aplicativos e realiza as interações entre o usuário e o X Window. Dependendo do gerenciador de janelas utilizado, o usuário poderá ter um ícone indicando as horas, outro para abrir um terminal de comandos etc. O Linux é um dos sistemas que mais possue gerenciadores de janela. Entre outros, podemos citar fvwm, olwm, mwm, Kde e gnome.
A finalização do X geralmente é feita através de alguma entrada de menu do tipo ``Exit Window Manager'', ou simplesmente ``exit''. Caso não seja encontrada alguma saída óbvia, basta digitar a combinação das teclas ++.